针灸店需要办理以下几项证件才能合法经营：

1、针灸许可证：这是最基础的证件，必须由国家卫生行政部门颁发，还需要有营业执照和税务登记证等其他相关证件。

2、非法经营许可证：只有在获得合法经营许可的情况下，才允许开设正规的针灸店铺。

3、遵守营业时间的规定：任何从事医疗活动的店铺都必须遵守特定的营业时间，不得进行非医学目的的诊疗活动。

4、从业人员健康证明：针灸师和其他工作人员都需要定期接受健康检查，以确保其身体健康，并且符合相关的职业标准。

5、营业场所的要求：店内应该干净整洁，设备齐全，有足够的安全防护设施，以及足够的空间供顾客活动。

6、经营管理规定：针灸店应制定详细的管理制度和流程，包括员工培训、服务质量、顾客反馈处理等方面。